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文章出處: 網(wǎng)責(zé)任編輯: 作者: 2018-12-08 16:54:00

 Beck強調(diào)稱:雖然機器學(xué)習(xí)確實能夠在特定診斷任務(wù)當中發(fā)揮重要的輔助作用,對于人工智能能否最終逾越并完全取代人類病理學(xué)家這樣的問題。但為病人找到最佳治療方法仍然需要多種類型臨床信息的配合,包括細胞染色、蛋白質(zhì)注釋、基因概括以及電子健康記錄等等。只有將這些信息進行認真篩選與組合,才干制定出明確的診斷與治療計劃。這種綜合能力正是人類病理學(xué)家的價值所在Beck認為,人工智能自身并缺乏以解決這個問題。

讓我先聊聊病理學(xué)家們?nèi)绾握热祟惿氖紫取?/p>

外科醫(yī)生就會從該潛在腫瘤處提取一個小小的柱狀活體樣本,當發(fā)現(xiàn)患者胸部掃描顯示肺部位置存在可疑腫塊。由病理學(xué)家進一步提取極薄的組織切片放在載玻片上通過顯微鏡進行觀察,判斷細胞中是否存在癌變跡象。最后,由醫(yī)生著手治療。

或是將顯微鏡下觀察到某些良性細胞誤判為癌細胞。后一種情況下,但這樣一個診療的過程也有局限性。即便是專業(yè)的病理學(xué)家和醫(yī)生也有可能忽略真正的癌細胞。病人將接受毫無必要的保守化療。

這個問題將在很大水平上被解決。利用大量數(shù)字化影像進行訓(xùn)練,而借助人工智能。人工智能系統(tǒng)能夠提供準確率遠超人類病理學(xué)家的診斷結(jié)論,甚至發(fā)現(xiàn)頂尖病理學(xué)家也無法發(fā)現(xiàn)的極為細小的病征。也就是說,針對于癌癥,人工智能將為醫(yī)生和病理學(xué)家提供重要的診斷與治療建議,并且這個過程有望在幾秒鐘之內(nèi)完成。

機器將使日益復(fù)雜的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)變得更易于管理,無疑。而人機組合的方式也將逾越單一一方的表示,給未來醫(yī)學(xué)發(fā)展帶來新的突破。

由機器學(xué)習(xí)算法驅(qū)動的各類診斷工具已經(jīng)進入臨床市場,過去的一年中。協(xié)助醫(yī)生在極少甚至根本無需人工輸入的前提下輕松發(fā)現(xiàn)手腕骨折、糖尿病并發(fā)性眼疾以及中風(fēng)等病征。然而,這些早期應(yīng)用僅僅負責(zé)自動完成專家診斷及醫(yī)師執(zhí)行方面的任務(wù),一般涉及解釋X光機片與CT掃描等影像。這類軟件在分析精度與準確率方面略微優(yōu)于訓(xùn)練有素的人類專家,且具備極為明顯的速度優(yōu)勢。然而,還不能從根本上擴展診斷規(guī)模。

AI病理學(xué)的發(fā)展更具有突破性。相比之下。

2019年美國食品與藥物管理局(簡稱FDA 或?qū)⑴鷾识嗉夜驹诓±韺W(xué)領(lǐng)域的第一款A(yù)I支持型工具。與放射學(xué)及眼科等單純面向某一領(lǐng)域的學(xué)科不同,據(jù)預(yù)測。AI病理學(xué)工具能夠?qū)⑸锘瘜W(xué)、免疫學(xué)乃至遺傳學(xué)領(lǐng)域的效果整合起來,從而為組織薄切片及染色樣本的圖像添加分子級別的細節(jié)觀察。

A I將大大減輕病理學(xué)家的工作壓力

曾在波士頓與合伙人共同興辦并經(jīng)營一家名為PathA I初創(chuàng)企業(yè)。表示,A ndrewH.Beck一位專業(yè)的病理學(xué)家。工具將真正改善診斷的準確性與治療效果,并認為,病理學(xué)將成為人工智能真正完全改變的第一個醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。

希望能夠協(xié)助病理學(xué)家利用載玻片上的數(shù)字化活體組織圖像發(fā)現(xiàn)癌細胞或者其它患病細胞。支持者們指出,Beck并不是唯一一位對此抱有樂觀態(tài)度的人。各大軟件巨頭(包括谷歌與IBM醫(yī)療設(shè)備制造商(包括飛利浦與徠卡生物系統(tǒng)公司)以及數(shù)十家初創(chuàng)企業(yè)正在開發(fā)相關(guān)的模式識別算法。據(jù)統(tǒng)計目前只有不到2%高校畢業(yè)生愿意進入病理學(xué)領(lǐng)域;而智能軟件的呈現(xiàn)則有望緩解全球人才短缺的現(xiàn)狀,同時減輕病理學(xué)專家和醫(yī)生的工作壓力。

同時接受過計算機科學(xué)培訓(xùn)。公司總部內(nèi),Beck自身對病理學(xué)與軟件都有著深入的理解。一位病理學(xué)家。Beck進行了一輪PathA I平臺演示。將一局部癌變肺組織數(shù)字圖像進行縮放,顯微鏡載玻片的規(guī)范視力與染色疊加圖之間切換,并通過突出顯示特定細胞或癌變相關(guān)蛋白做出內(nèi)容注釋。

并將其與例如腫瘤侵襲性、治療計劃與治療結(jié)果等臨床數(shù)據(jù)加以結(jié)合,利用數(shù)字載玻片圖像數(shù)據(jù)PathA I對其機器學(xué)習(xí)算法進行了訓(xùn)練。從而實現(xiàn)遠超任何頂尖人類醫(yī)師的統(tǒng)計分析能力。

PathA I模型不只能對癌細胞進行檢測并評估腫瘤的狀態(tài),據(jù)了解。同時還能給出相關(guān)的治療建議。通過計算解圍在腫瘤周邊的免疫細胞,并判斷這些細胞是否具有某些特性的方式,考量最新的免疫療法是否奏效。

這種方式對于像Bristol-MySquibb簡稱BMS這樣的藥物開發(fā)商來說極具價值。因為BMS一直希望借此確定為什么只有一小局部臨床試驗參與者對抗癌藥物有所反應(yīng)。

團隊目前正在依靠PathA I技術(shù)確定活檢樣本中的腫瘤細胞是否被偽裝蛋白質(zhì)所覆蓋—這種情況下,BMS公司翻譯病理學(xué)負責(zé)人MichaelMontalto解釋稱。免疫細胞無法將癌細胞正確識別進去。BMS免疫治療藥物能夠有效剝開覆蓋層,從而激發(fā)病患身體對于癌細胞的殺滅功能。表示,這還只是人工智能發(fā)現(xiàn)作用的案例之一,接下來BMS還將把這項技術(shù)引入所有病理試驗中。

癌癥的秘密

 

 

 

 

為了協(xié)助醫(yī)生們治愈肺部腫瘤,PathA I軟件會繪制現(xiàn)有組織類型(圖一)其中的紅色局部為指示癌癥發(fā)展的上皮細胞。此外,還制作出了一份免疫細胞圖(圖二)其中的黃色方塊指示的新的免疫治療藥物對腫瘤起到治療效果。

而在于建立起判斷每位癌癥患者腫瘤性質(zhì)的規(guī)范診斷流程并指導(dǎo)治療方案。但這一市場的建立面臨著一項挑戰(zhàn):即整個病理學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施都需要隨之改變。荷蘭蘭道爾大學(xué)醫(yī)療中心計算病理學(xué)家JeroenvanderLaak指出,更重要的人工智能病理學(xué)市場的核心機遇并不在于研究環(huán)境當中。要使用這些算法,必需首先將切片圖像進行數(shù)字化轉(zhuǎn)錄,但現(xiàn)在大多數(shù)機構(gòu)都沒有相關(guān)的處置設(shè)施。

從而進行歸檔或事后研究,雖然不少病理學(xué)實驗室目前都會為載玻片樣本制作數(shù)字拷貝。但只有少數(shù)早期采用者(主要在歐洲)會進行預(yù)先掃描以引入診斷過程。由于這項技術(shù)本錢高貴,因此醫(yī)院在引入自動化全切片成像設(shè)備方面進展非常緩慢:掃描價的價格高達25萬美元,另外存儲億級像素高清圖像文件也會帶來額外的資源本錢。

俄亥俄州立大學(xué)綜合癌癥中心數(shù)字病理學(xué)負責(zé)人AnilParwani堅持認為這項投資將物有所值。該中心是全美唯一一家將切片數(shù)字掃描作為慣例診斷工作流程的機構(gòu)。Parwani解釋稱,然而。由于醫(yī)師工作效率的提高以及診斷錯誤的減少,該醫(yī)院引入的全數(shù)字平臺有望在五年之內(nèi)收回本錢。此外,數(shù)字化切片還能夠?qū)崿F(xiàn)在線文件共享,而無需寄送實體切片進行遠程診斷或收集參考意見。Parwani指出,這使得工作流程變得更為穩(wěn)定可靠。病理學(xué)家們能夠立即對間隔數(shù)月的活檢影像進行比擬,或者在差旅途中檢查病例。

PathA I如何創(chuàng)建的

Beck布朗大學(xué)醫(yī)學(xué)院求學(xué)時開始涉足量化圖像分析。與病理學(xué)家MurraiResnick合作,2000年初。共同開發(fā)出了一款計算機程序,用于評估食道細胞的大小、形狀及其它特征,從而確定患者罹患食道癌的風(fēng)險。雖然并不屬于深度學(xué)習(xí)算法,但由此激發(fā)的量化醫(yī)學(xué)興趣促使他選擇了斯坦福大學(xué),并在AI科學(xué)家DaphnKoller實驗室中攻讀病理學(xué)博士學(xué)位。研究最終成績了ComputPathlogist簡稱C-Path系統(tǒng)的誕生,這是一款相當原始的機器學(xué)習(xí)工具,用于評估乳腺腫瘤的嚴重水平。2011年,該小組公布了研究結(jié)果,這也成為人工智能在病理學(xué)領(lǐng)域中的首批應(yīng)用之一。

那時候“還沒人采用這種廣泛的數(shù)據(jù)驅(qū)動方法解決這類問題。之前的自動化組織分析嘗試當中,Koller回憶道。研究人員一般會告知順序要尋找哪些特征—Beck與Resnick采取的都是這種方法。五年之前他食道癌研究中就做過類似的工作。通過C-PathBeck為他算法提供了數(shù)百項特征,涵蓋幾乎每一項他能夠想到并可以檢測得出的特征。至于剩下的工作,就交給計算機代碼處理了

而在于周邊位置—人類病理學(xué)家很少會以這樣的方式做出判斷。VandeRijn指出,借助C-PathBeck發(fā)現(xiàn)乳腺癌疾病最具可預(yù)測性的特征不在于腫瘤細胞自身。這絕對是個驚人的發(fā)現(xiàn),甚至有可能帶來新的病理學(xué)解釋方法。

Beck回到美國東部,結(jié)束了斯坦福的求學(xué)經(jīng)歷。哈佛醫(yī)學(xué)院附屬的貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心興辦了自己的研究小組。這里,退出了機器學(xué)習(xí)研究,開始關(guān)注癌癥流行病學(xué)。但在2015年,由荷蘭研究人員發(fā)起的一場國際競賽又讓他重新投身于利用人工智能顛覆世界的嘗試。

Beck團隊設(shè)計出一套兩步式驗證系統(tǒng),這次競賽中。旨在確保人工智能最初標志為“健康”所有組織塊都確實不存在癌變跡象。確定載玻片是否包括腫瘤細胞以及確定癌組織在較大組織樣本中的位置方面,其算法甚至在一定水平上超過了專業(yè)病理學(xué)家的水平。借此,Beck團隊最終擊敗了其他22支隊伍,這場競賽當中拔得頭籌。

這次經(jīng)歷讓他獲得了建立初創(chuàng)企業(yè)的信心。2017年1月,Beck表示。辭去了哈佛大學(xué)的終身職位,創(chuàng)立了PathA I公司。

三大決策支持工具

PathA I公司正在開發(fā)三種類型的決策支持工具:目前。

用于處置病理學(xué)家們最討厭的重復(fù)性工作的工具,第一。例如識別淋巴結(jié)中的轉(zhuǎn)移跡象以及是否存在癌細胞等簡單測定。這類工作并不困難,但卻極為耗時而且會給人類專家?guī)砭薮蟮呢摀?/p>

涉及確定癌癥的等級”工具。約翰霍普金斯大學(xué)的病理學(xué)家JohnathanEpstein指出,第二。這種關(guān)于腫瘤侵襲性的判斷“非常困難,充溢主觀性,同時也在治療當中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。PathA I公司顧問兼泌尿外科癌癥專家Epstein正在努力訓(xùn)練可用于診斷前列腺及其它器官腫瘤的算法;

生物標志物檢測工具。制藥企業(yè)可以借此了解哪些患者群體能夠從自己的藥物中受益。如果在臨床試驗當中得到驗證,第三。那么這些算法將能夠協(xié)助醫(yī)生為患者提供個性化用藥建議。

PathA I公司已經(jīng)測試了其軟件在肺部、膀胱癌、皮膚癌、前列腺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌以及胃癌方面的表示。Beck總結(jié)稱,截至目前。這套平臺非常易于遷移,也正因為如此,才干利用其處置幾乎所有主要腫瘤疾病。隨著新項目與新指標的不時引入,其表現(xiàn)也在繼續(xù)提升。